UASB厌氧反应器废水被尽可能均匀的引入反应器的底部，污水向上通过包含颗粒污泥或絮状污泥的污泥床。厌氧反应发生在废水和污泥颗粒接触的过程。在厌氧状态下产生的沼气(主要是甲烷和二氧化碳)引起了内部的循环，这对于颗粒污泥的形成和维持有利。

在污泥层形成的一些气体附着在污泥颗粒上，附着和没有附着的气体向反应器顶部上升。生物厌氧反应器污水经化粪池后，自流（泵）至厌氧生物滤罐内，自下而上通过悬浮生物填料，该填料具有较大的比表面积，为厌氧微生物的繁殖提供了舒适的生长环境，使厌氧滤罐内维持很高的厌氧微生物，